Евгений Ковалев родился 15 мая 1982 года в Уральске.
В 2007 году окончил ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского» по специальности «Лечебное дело» с присвоением квалификации «Врач».
С 2006 года по 2007 год учился в Национальном институте «Высшая школа управления» и Малой академии государственного управления Саратовской области, созданной на базе ФГОУ ВПО «ПАГС им. П.А.Столыпина».
С 2007 года по 2009 год – врач-ординатор кафедры «Экономика и управление здравоохранением и фармацией» ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского».
В 2009 году окончил ординатуру ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского», курс по специальности «Организация здравоохранения, общественное здоровье».
В 2012 году завершил заочное обучение в ФУБОУ ВПО «РАНХиГС при Президенте Российской Федерации» по специальности «Государственное и муниципальное управление» с присвоением квалификации «Менеджер».
В 2007 году был избран депутатом Саратовской областной Думы четвертого созыва.
В 2009 году назначен заместителем главного врача по организационно-методической работе Клинической больницы № 3 ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского».
С мая 2009 года по май 2016 года работал главным врачом ГУЗ «Саратовская стоматологическая поликлиника № 5».
С мая 2016 года по октябрь 2019 года – главный врач ГУЗ «Саратовский областной клинический госпиталь для ветеранов войн».
С ноября 2017 года по 2022 год – депутат Саратовской областной Думы шестого созыва.
С октября 2019 года по настоящее время – главный врач ГУЗ «Саратовская городская клиническая больница № 1 им. Ю.Я.Гордеева».
В сентябре 2022 года избран депутатом Саратовской областной Думы седьмого созыва.
В 2022 году присвоена степень кандидата медицинских наук.
С марта 2023 года по настоящее время – доцент кафедры ОЗД ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского».
